A templom alapkövét 1842. október 3-án tették le Csekonics József (Josip Cekonjic) kezdeményezésére, a templomot pedig 1844-ben szentelték fel – ekkor szólalt meg először a harang és az orgona. A felújítási munkálatok 2007-ben kezdődtek.
Magyarcsernyén (Nova Crnja) egyetlen katolikus templom van. A felújítás során kicserélték a tetőt és a padlót, és a külső és belső falakat is rendbe hozták. A munkálatok fő támogatója a Tartományi Beruházási Alap, a Nagybecskereki Egyházmegye, a németországi „Kirche in Not” alap és egyéni adományozók voltak.